Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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