Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP13Q92995 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
USP13Q92995 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP13Q92995 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms