Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCD1Q6ZMY3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms