Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP13-3Q3SY46 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms