Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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