Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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