Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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