Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms