Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms