Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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