Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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