Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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