Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CSTF3Q12996 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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