Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms