Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TFF3Q07654 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TFF3Q07654 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TFF3Q07654 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TFF3Q07654 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TFF3Q07654 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TFF3Q07654 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TFF3Q07654 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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TFF3Q07654 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TFF3Q07654 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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