Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms