Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms