Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms