Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms