Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BGRP55822 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BGRP55822 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BGRP55822 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms