Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms