Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms