Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3CBP42338 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms