Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms