Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms