Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB5P28074 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB5P28074 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB5P28074 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB5P28074 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB5P28074 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB5P28074 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB5P28074 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB5P28074 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB5P28074 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB5P28074 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB5P28074 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms