Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCP2P22307 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms