Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETFAP13804 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETFAP13804 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETFAP13804 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETFAP13804 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETFAP13804 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETFAP13804 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETFAP13804 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETFAP13804 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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