Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A6NL46 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
A6NL46 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms