Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms