Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTSFQ9UBX1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTSFQ9UBX1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTSFQ9UBX1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CTSFQ9UBX1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CTSFQ9UBX1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CTSFQ9UBX1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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