Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT1Q9P2V4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LRIT1Q9P2V4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT1Q9P2V4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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