Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KCMF1Q9P0J7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms