Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP29Q9HBJ7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms