Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLVAPQ9BX97 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms