Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms