Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms