Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS8Q8N3P4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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