Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CCDC36-204ENST00000452691 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms