Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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