Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2B3Q16720 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2B3Q16720 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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