Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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GABRA6Q16445 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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GABRA6Q16445 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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GABRA6Q16445 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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GABRA6Q16445 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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