Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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