Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP4Q15650 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms