Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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COL9A3Q14050 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A3Q14050 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A3Q14050 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A3Q14050 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A3Q14050 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A3Q14050 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A3Q14050 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL9A3Q14050 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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