Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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