Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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