Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFCP2Q12800 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms