Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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