Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms